Neseniai moksliniame žurnale „Plants“ paskelbtame straipsnyje analizuojamas dabartinis genų bankų bendradarbiavimas Europoje. Darbą kartu parašė CGN augalų genų banko vadovas, Europos augalų genetinių išteklių bendradarbiavimo programos (ECPGR) sekretorius ir buvęs virtualaus Europos genų banko iniciatyvos (AEGIS) koordinatorius. Šios savirefleksijos rezultatas buvo išsamus dokumentas su aiškiomis išvadomis.
Bendradarbiavimas Europoje
Europos augalų genetinių išteklių bendradarbiavimo programa (ECPGR), skėtinė Europos šalių organizacija augalų genetinių išteklių srityje, per pastaruosius keturis dešimtmečius sukūrė daug vertingų bendrų Europos genų bankų veiklos. Tačiau tai nepadėjo iš esmės sustiprinti bendradarbiavimo.
Siekiant pagerinti šią situaciją, 2004 m. buvo įkurta AEGIS (trumpinys – „Europos genų banko integruota sistema“). AEGIS yra ECPGR iniciatyva, kuria siekiama efektyviai išsaugoti unikalią gemalo plazmą ir suteikti prieigą prie jos Europoje. Tai virtualus genų bankas, administruojantis „Europos kolekciją“, susidedantis iš prisijungimų, kuriuos valdo AEGIS nariai (genų bankai), kurie organizuoja ir padengia ilgalaikio šių priedų išsaugojimo ir platinimo išlaidas. AEGIS medžiaga turi būti tvarkoma pagal sutartus kokybės standartus ir turėtų būti laisvai prieinama pagal Tarptautinėje sutartyje dėl maisto ir žemės ūkio augalų genetinių išteklių nustatytas sąlygas.
Siekdami išanalizuoti ir įvertinti bendradarbiavimą, rašė CGN augalų genų banko vadovas Theo van Hintumas, Europos augalų genetinių išteklių bendradarbiavimo programos (ECPGR) sekretorius Lorenzo Maggioni ir buvęs AEGIS koordinatorius Johannesas Engelsas. neseniai paskelbtas straipsnis „AEGIS – virtualus Europos genų bankas: kodėl tai tokia gera idėja, kodėl ji neveikia ir kaip ją būtų galima patobulinti“. Straipsnyje aprašoma augalų genetinių išteklių (PGR) išsaugojimo Europoje istorija ir kodėl genų bankų bendradarbiavimas nuo ECPGR įkūrimo reikšmingai nepagerėjo. Autoriai pastebi, kad (1) dažnai augalų genetiniai ištekliai yra dubliuojami daugelyje kolekcijų, o kitos svarbios medžiagos trūksta, (2) prieiga prie medžiagos, jei iš viso yra, dažnai apsiriboja nedidele žmonių grupe, pvz. kolegos institute, projekto partneriai ar riboto tinklo nariai, o svarbiausia, (3) konservavimo metodikų ir konservuojamos medžiagos kokybė yra neaiški ir galbūt dažnai labai žema.
Kodėl AEGIS neveikia
Autoriai pastebi, kad AEGIS kol kas nepasisekė. Į šį virtualų genų banką įtraukta per mažai medžiagos: 65,267 3.2 prisijungimai, tai tik XNUMX% medžiagos, užregistruotos Europos genų banko duomenų bazėje EURISCO. Taip yra daugiausia dėl to, kad nėra tinkamų paskatų įtraukti medžiagą į AEGIS, o genų bankai nelinkę įsipareigoti laikytis reikiamų kokybės standartų be tokių paskatų. Taip pat nėra užtikrinta įtrauktos medžiagos kokybė ir prieiga prie jos, nes nėra mechanizmo, kuris patikrintų, ar laikomasi kokybės standartų.
Kaip būtų galima patobulinti
Genų bankai negali ir nepasikliaus vieni kitais, jei negali būti tikri dėl kolegų genų bankų valdomų kolekcijų kokybės ir tęstinumo. Todėl pabrėžiamas poreikis įdiegti kokybės sistemą, kurioje genų bankai galėtų būti sertifikuoti AEGIS. Tokios sistemos rezultatas būtų toks, kad AEGIS sertifikuoti genų bankai galėtų gauti paramą nacionaliniu ir regioniniu lygiu, nes jie turėtų būti patikimi genetinių išteklių išsaugojimo dalyviai. Institucijos, kurios nori tapti AEGIS sertifikuotais genų bankais, bet dar neatitinka reikalavimų, turėtų būti remiamos ECPGR ir kitų donorų, kad pasiektų šį tikslą – stiprinant gebėjimus, keičiant personalą, remiant reikiamų patalpų įrengimą ir kt.
Kolekcijos tęstinumas galėtų būti įgyvendintas sukuriant „atvirą atsarginę sistemą“. Saugos atsarginis kopijavimas yra standartinė visų gerai veikiančių genų bankų veikla; jie siunčia savo medžiagos pavyzdžius kolegos genų bankui ir Svalbardo pasauliniam sėklų saugyklai. Tačiau šiuo metu tai daroma juodosios dėžės konstrukcijose, kuriose prie jos gali patekti tik medžiagos donoras. Autoriai siūlo šiek tiek pakeisti šią procedūrą, sutikdami, kad atsarginio genobanko priedai gali būti naudojami įtraukiant į kitą AEGIS genų banko kolekciją tuo nepageidaujamu atveju, kai pradinis turintis genų bankas nebegalės suteikti prieigos prie šių priedų.
Autoriai daro išvadą, kad Europos genų banko bendruomenė aiškiai turi norą profesionalizuotis ir bendradarbiauti. Sukūrus tinkamas paskatas ir sukūrus tinkamą infrastruktūrą, remiamą finansavimo agentūrų ir politikos formuotojų, autoriai mano, kad Europoje galima sukurti veiksmingą bendradarbiavimo genų bankų sistemą.
Daugiau informacijos:
Vageningeno universitetas ir tyrimai
www.wur.nl